ChemHack 中文频道

号外号外，Google半只脚迈出中国了

段炼 — Mon, 22 Mar 2010 22:10:20 +0000

根据路过社最新发来的报道，Google已经半只脚迈出的国内。Google.cn与g.cn已经转移到google.com.hk，即Google香港。谷歌地图（ditu.google.cn）等本地化服务仍没有变化。路人甲继续监视中。

买了个g1,又买了个hero

段炼 — Fri, 19 Mar 2010 18:46:47 +0000

在ebay上看到有不少g1在卖，凑热闹去拍了个二手的。我出价128个英国棒子，结果竟然有人在最后15秒出了136。嘿嘿，我不跟你抢。再拍，128拍到了个全新的。嘿嘿，赚到了。

可是这个卖家是个反应迟钝的主，付款了都三天了才发货。等啊等啊又看到gumtree上有卖g3的，orange的免费upgrade，不想要了想折现。200英国棒子，见面交易。看这价不错，就去面交收来了。贼让人满意的手机。。。

今天g1终于送到了，到了之后我就郁闷了，g1的键盘实在好用。配合谷歌拼音基本无敌了。于是开始纠结g1和g3了。一个打字快，一个系统快。虽然我不是啥重度键盘用户，但是在g3上打上面这么些字可费劲了。恩。这么多字都是g3打的。要是g1估计一半功夫就打完了。

据说g1的系统没法再升级了，自己用下来，开机之后内存只有可怜的40m，程序开多了就会卡。传说中自动对焦的摄像头简直就是山寨机水平。

g3啥都好，但是就是没键盘，我纠结了。貌似我是需要键盘的话痨？貌似现在的机器键盘利用率挺低的。

真折腾。不折腾不舒服斯基。。。。

火车余票查询API

段炼 — Fri, 29 Jan 2010 14:03:13 +0000

最近铁道部干了件好事，有了一个在线余票查询的网站。这是件好事，不过网站也继承了党办网站的光荣传统，Internet Explorer only。这AJAX不光是IE only，还是IFRAME实现，真是个神奇的网站。

不扯了，极光照耀下IE不敢久用，于是做了个API，暂定0.1版，爱哪用那用。

下面来个Example

比如我要查询2月2号北京到上海的车票，那么API调用就是
http://chemhack.com/train/0.1/json/?date=2010-01-29&from=北京&to=上海
或者你也可以指定车次，比如D301好了(这车7xx的票价真是狗血)
http://chemhack.com/train/0.1/json/?date=2010-02-03&from=北京&to=上海&no=D301

然后就返回了格式类似这样的玩意

[
{"车次":"K187","始发站":"沈阳北","终到站":"上海","上车站":"枣庄","下车站":"上海","发时":"06:47","到时":"16:53","历时":"10:06","硬座":"0","硬卧":"1","软卧":"0","无座":"有"},
{"车次":"D29","始发站":"北京南","终到站":"上海","上车站":"枣庄","下车站":"上海","发时":"13:14","到时":"18:44","历时":"05:30","动车组一等座":"0","动车组二等座":"12","无座":"有"},
{"车次":"T177","始发站":"济南","终到站":"杭州","上车站":"枣庄","下车站":"上海南","发时":"20:54","到时":"04:26","历时":"07:32","硬座":"0","硬卧":"14","软卧":"3","无座":"有"}
]

JSON 你懂的
Simple, Easy, Naive

返回结果用了中文JSON；用英文，大家都费劲；用拼音，你不懂，我也不懂。

改日做一个手机WAP客户端，买火车票之前先排队看看。

P.S. 铁道部网站的数据是一个小时一更新。

统计数字是不是拍脑袋出来的？87.53%

段炼 — Thu, 17 Dec 2009 09:01:02 +0000

以下来自Solidot:

“87.53”这一数字近来走红网络：调查100个人，为什么会出现87.53%结果呢？这没什么奇怪，因为统计是编的，而编者可能数学没学好，他/她信守写了一个完全不合逻辑的数据，结果贻笑大方。如果真的是随机调查，那么：第一结果肯定应符合实际，第二它也会呈现出某种统计规律，比如本福特定律（0到9的使用概率呈从高到低分布，排在前面的使用频率最高，排在后面的使用频率越低）。今年6月举行的伊朗大选，美国的研究人员分析了各个选区候选人所得票数的个位数字，结果发现与本福特定律不符，于是断言大选舞弊的可能性超过九成五。
如果统计是编出来的（或者不是编出来的），结果也会呈现出规律，因为数字是有限的，比如统计常用xx.xx%的格式，共包含10000个数字，当样本量够大（超过10000）时，编出来的结果肯定会出现重复，这是抽屉原理所决定的。抽屉原理的简单表述是“若有n个笼子和n+1只鸽子，所有的鸽子都被关在鸽笼里，那么至少有一个笼子有至少2只鸽子”。87.53%并不神奇，鉴于gov.cn各网站已经积攒了足够多的统计数字，你可以搜索类似的数字（使用Google site:Gov.cn），比如17.53%（10,400个结果）、27.53%（55,700）、37.53%（7,030）、47.53%、57.53%、57.53%、67.53%、77.53%、87.53%（4,750）、97.53%；或者你也可以随手写一个如12.34%。如果有人足够闲，可以写个小程序，遍历全部xx.xx%在gov.cn的分布情况，看看是不是真的有特别被偏爱的数字，至少87.53%并不够神奇。

－－－－－－－－－－－－－－－以下为本人瞎写－－－－－－－－－－－－－－－－

我不够闲，但是本着严肃的八卦精神，还是写了个小程序把数据爬了一下。为了体现数据的严肃性，爬了xx.yy%（0.01%~99.99%）在以下几个网站中返回的结果个数。（使用site:xxx.com作为搜索参数进行限定）

sites=c(“all”,”gov.cn”,”stats.gov.cn”,”163.com”,”sohu.com”,”xinhuanet.com”,”wikipedia.org”)

“gov.cn”,”stats.gov.cn”,”163.com”,”sohu.com”,”xinhuanet.com”,”wikipedia.org”

作为对照，又爬了Google收录的所有网站中返回的结果数。获取的全部数据我放置在了 http://chemhack.com/data/googleNums/ （逗号分割文本格式）。

注：Google本身并不搜索百分号（％），不管你搜索5.04还是5.04%，获得的结果都是一样的。

写了个R脚本，画张图，给个整体印象。x轴就是统计数字（xx.yy%），y轴是他们出现的次数。

情理之中，意料之外，统计局（stats.gov.cn）的图形是最漂亮的。不过其中奥秘之处还有待高人分解。

帖图两张无评论

段炼 — Sun, 01 Nov 2009 04:57:48 +0000

德国签证流水账

段炼 — Sat, 17 Oct 2009 17:07:14 +0000

又是好久没更新了，得上来冒个泡。话说去年冬天无意中做了jsMolEditor，到现在还是preview状态。暑假的时候看到了German Conference on Chemoinformatics在征集Poster，就写了个Abstract，请Rich帮忙用他纯正的native scientific English润色了一下，投了出去。开学没多久，GDCh告诉俺这Poster收了。收了那就去开会吧，去见见大牛教授们。轻轻的俺来了，就带了一个poster，轻轻的俺走了，送俺一个offer吧。

下面开始签证流水账，首先你需要一个护照。现在护照已经实行按需申办了，就是想办就办了，出国理由就填“旅游”好了，这个是万能理由（换外汇也是如此）。现在上海办护照可以在邮局通过EMS快递申请表，方便了不少，不用自己去跑路排队了。办护照用的户口本对于在校学生的集体户口来说自然是没有的，这时候就需要开个户籍证明了。连同3张照片，一张申请表，外加身份证、户籍证明复印件一同交给邮局窗口，邮局会帮你快递出去，过几天你就能收到一封回执，上面写有你的领证日期。一般大概是10个工作日，办好之后取来就行了，交费200块。有效期一般为10年，如果没啥需要提前申领好了也没啥坏处，反正10年才过期。

护照OK了之后，就是签证。预约签证直接给他们发邮件吧，那个电话永远打不通。德国的短期申根签证大概也就是旅游探亲和商务这两种。去开会算是商务签证，按照德国领事馆网站关于商务签证的说明准备申请材料即可。必不可少的材料如下：申根签证申请表、对方的邀请函（尽量是亲笔签名的原件，万不得已用PDF打印件也可以）、自己学校的介绍信、保险单复印件、资金证明（在邀请函或者介绍信里说明费用由谁承担）。以上所有的材料都需要是英文或德文或中英或中德文对照。

介绍信这样格式即可 XXX(护照号码:xxxx)是我校xxx学院xxx专业学生，本校准予XXX于xxx期间到xxx参加xxx会议并xxx。XXX将在会议之后返回学校并继续完成学业XXX。保险随便买哪家，保额在30000欧以上即可，有英文或者中英对照保单即可。保单最好提早打算，我到快签证的时候才想起买保险，结果国庆期间，保险公司都不上班。幸亏法国人不上班，在线买了，然后彩打出来，一样OK。办签证的时候可以选择把护照EMS回来。这样签证做好之后会直接EMS给你，不用自己上门排队了。上海市内35块，还是可以接受。顺利的话5个工作日就可以拿到签证。

以上为流水账，希望碰巧有谁Google进来能有所帮助。

2009.9.11深夜暴走华东理工->外白渡桥

段炼 — Sat, 12 Sep 2009 12:15:16 +0000

2009年9月11日为纪念9.11事变8周年 mlkz深夜党一行6＋1（半路加入）人开始了华东理工->外白渡桥的17km的深夜暴走

9月11日夜 10:30 于华东理工大学梅陇校区大草坪毛主席像后拍摄

东门口的行知路

老沪闵路

沪闵路地道

高架下

某医院

漕溪路立交

徐家汇公园的滑梯

偷拍中的李翔同学

这是只猫。。。

衡山路上一个阴森的院子拍电影的？

半路休息，星星（见下图）请客夜宵（可乐）-.-!

传说中的龙柱，天机不可泄露。

路上的广告，右边还有“彩”字。。。

然后抵达南京东路，大概是凌晨2点多，诺大的南京路步行街上就没啥人。。。

快走道外滩了，结果看到这么一个玩意

那就不去外滩了，直接去外白渡桥

绕到了俄罗斯领事馆之后，大家基本已经都不行了，分两辆车打车回人民广场，斗地主。。。

我连续当了2×2次地主，赢了2^2次。。。

空空的八号线站台

回学校，天亮，睡觉，夜暴结束。。。

Beijing Open Party

段炼 — Fri, 11 Sep 2009 12:00:19 +0000

Beijing Open Party结束了两周了，个位同学blog了那么多东西，俺啥也没share，甚是惭愧。刚看到Open Party的网站的总结贴，干脆就暴张照片上来吧。

至于有夸到俺的贴子，俺就低调的给个链接 1 2。

化学信息学101(1)

段炼 — Thu, 20 Aug 2009 17:35:14 +0000

注：本文由段炼翻译自eMolecules，英文原文版权由eMolcules所有，转载请注明。

原文地址：http://www.emolecules.com/doc/cheminformatics-101.php

化学信息学101

关于化学信息系统的计算机科学与化学介绍

Craig A. James, eMolecules公司

第1章.化学信息学基础

什么是化学信息学？

化学信息学是计算机科学与化学的一个交叉学科：主要和化合物有关信息的储存与检索打交道。

信息系统所涉及的是存储、检索和搜索信息和信息之间的关系。例如：

操作	传统信息系统		化学信息系统
存储	Name= ‘Jimmy Carter’	储存文本、数字、日期 …		储存化合物和有关信息。
检索	查找记录＃13282	检索’Jimmy Carter’	查找： CC(=O)C4CC3C2CC(C)C1=C(C) C(=O)CC(O)C1C2CCC3(C)C4	检索：
搜索	查找名为’Bush’的总统	George Bush 和 George W. Bush	查找包含以下结构的分子：	返回：
关系	Carter当选的年份	答案：1976年当选	该分子的logP(o/w):	logP(o/w) = 2.62

化学信息学什么不同？

化学信息系统主要解决四个关键问题：

1、保存分子	计算机科学家通常使用的化学价键模型表示化合物。Section 2，分子表示，将会信息讨论这个问题。
2.找到确切的分子	如果你问， “Abraham Lincoln在不在数据库中？”这不难找到答案。但是，给出某一个的分子，它在不在数据库中？关于它我们都又什么数据？乍看之下这似乎简单，但是当我们讨论到互变异构体、立体化学、金属，和其他“瑕疵”的化学价键模型时，就不是那么简单了。
3.子结构检索	如果你问， “数据库中有没有叫Lincoln的人？ ”你通常期望找到Lincoln总统和其他一些人-这就是所谓的搜索，而不是查找。对于化学信息系统，我们有子结构搜索：查找所有含有用户所画出的部分分子结构（以下简称“子结构” ）的分子。子结构通常是一个官能团，脚手架，或代表了一类分子的核心结构。由于一些很底层的数学与可计算性理论的原因，这也是一个很难的问题，要比大多数文本搜索难的多。
4.相似性搜索	一些数据库可以找到发音相似或拼写错误的字词，如“查找Lincon”或“找到Cincinati” ，它们分别可以找到Abraham Lincoln和Cincinnati。许多化学信息系统可以找到与指定的分子相似的分子，并按照相似性排名。衡量分子相似性又好几种方法，Section 4，分子相似性中会进行深入讨论。